Bacteriology

Microbiology 

Notes… 

1 

Bacteriology Lecture.1 

Introduction 

Microbes in Our Lives 

  Microorganisms are organisms that are too small to be seen with the unaided eye. 
  “Germ” refers to a rapidly growing cell. 

Microorganisms: 

  Good 

Decompose organic waste 
Produce industrial chemicals such as ethyl alcohol and acetone 
Produce fermented foods such as vinegar, cheese, and bread 

  Bad 

Pathenogenic  

Naming and Classifying Microorganisms 

  Linnaeus established the system of scientific nomenclature. 
  Each organism has two names: the genus and specific species. 

Scientific names 

  Are italicized or underlined. The genus is capitalized and the specific species is 

lower case. 

  Are “Latinized” and used worldwide. 
  May be descriptive or honor a scientist. 
 

Staphylococcus aureus

—  Describes the clustered arrangement of the cells (staphylo-) and the golden 

color of the colonies. 

 

Escherichia coli

—  Honors  the  discoverer,  Theodor  Eshcerich,  and  describes  the  bacterium’s 

habitat, the large intestine or colon. 

  After the first use, scientific names may be abbreviated with the first letter of the 

genus and the specific species: 

— 

Staphylococcus aureus

 and 

Esherichia coli

 are found in the human body. 

S. 

aureus

 is on skin and 

E. coli

, in the large intestine. 

Microorganisms: 

N

ee

d S

om

e H

el

p?

Microbiology 

Notes… 

2 

Bacteria 

  Prokaryotes 
  Peptidoglycan cell walls 
  Binary fission 
  For energy, use organic chemicals, inorganic 

chemicals, or photosynthesis 

Archaea: 

  Prokaryotic 
  Lack peptidoglycan 
  Live in extreme environments 
  Include: 

—  Methanogens 

—  Extreme halophiles 

—  Extreme thermophiles 

Fungi 

  Eukaryotes 
  Chitin cell walls 
  Use organic chemicals for energy 
  Molds and mushrooms are multicellular consisting of masses of mycelia, which 

are composed of filaments called hyphae 

  Yeasts are unicellular 

Protozoa 

  Eukaryotes 
  Absorb or ingest organic chemicals 
  May be motile via pseudopods, cilia, or flagella 

Microbiology 

Notes… 

3 

Algae 

  Eukaryotes 
  Cellulose cell walls 
  Use photosynthesis for energy 
  Produce  molecular  oxygen  and  organic 

compounds 

Viruses 

  Acellular 
  Consist of DNA 

or 

RNA core 

  Core is surrounded by a protein coat 
  Coat may be enclosed in a lipid envelope 
  Viruses are replicated only when they are in a 

living host cell 

Taxonomy 

—  The science of classifying organisms 

—  Provides universal names for organisms 

—  Provides a reference for identifying organisms 

Classification of Microorganisms 

  Three domains 

—  Bacteria 

—  Archaea 

—  Eukarya 

  Protists 
  Fungi 
  Plants 
 

Animals

Microbiology 

Notes… 

4 

Prokaryotes 

Bacteria (or Eubacteria) 
Most abundant on earth 
They are nitrogen fixers and recycle carbon 
No membrane bound organelles 
Archaea 
Methanogens 
Halophiles 
Hyperthermophiles 
Major Taxonomic Groups of Bacteria per 

Bergey’s manual

  Gracilicutes – gram-negative cell walls, thin-skinned 

  Firmicutes – gram-positive cell walls, thick skinned 

  Tenericutes – lack a cell wall & are soft 

  Mendosicutes  –  archaea,  primitive  procaryotes  with  unusual  cell  walls  & 

nutritional habits 

Domain Eukarya 

  Animalia: Multicellular; no cell walls; chemoheterotrophic 
  Plantae: Multicellular; cellulose cell walls; usually photoautotrophic 
  Fungi:  Chemoheterotrophic;  unicellular  or  multicellular;  cell  walls  of  chitin; 

develop from spores or hyphal fragments 

  Protista:  for eukaryotic organisms that do not fit other kingdoms 

Identification Methods 

  Morphological characteristics: Useful for identifying  
  Differential staining: Gram staining, acid-fast staining 
  Biochemical tests: Determines presence of bacterial enzymes 

Microbiology 

Notes… 

5 

Serology 

  Combine known antiserum + unknown bacterium 
  Slide agglutination 
  ELISA 
  Western blot 

Branches of Microbiology 

  Bacteriology is the study of bacteria. 
  Mycology is the study of fungi. 
  Parasitology is the study of protozoa and parasitic worms. 

Microbiology 

Notes… 

6 

  Immunology  is  the  study  of  immunity.  Vaccines  and  interferons  are  being 

investigated to prevent and cure viral diseases. 

  The use of immunology to identify some bacteria according to serotypes (variants 

within a species) was proposed by Rebecca Lancefield in 1933. 

  Virology is the study of viruses. 
  Recombinant DNA technology or genetic engineering involves microbial genetics 

and molecular biology.